1.В соответствии с Планом счетов бухгалтерского учета учет затрат по вашим видам деятельности нужно вести на счетах 20 «Основное производство», счете 25 «Общепроизводственные расходы» и счете 26 «Общехозяйственные расходы».
2.В соответствии со статьей 346.26 Налогового кодекса РФ налогоплательщики, осуществляющие наряду с предпринимательской деятельностью, подлежащей налогообложению единым налогом на вмененный доход, иные виды предпринимательской деятельности, обязаны вести раздельный учет имущества, обязательств и хозяйственных операций в отношении предпринимательской деятельности, подлежащей налогообложению ЕНВД, и предпринимательской деятельности, в отношении которой налогоплательщики уплачивают налоги в соответствии с иным режимом налогообложения.
Таким образом, заработную плату руководителей и специалистов, занятых на всех видах деятельности, а также иные расходы, подлежащие распределению, вам придется учитывать раздельно.