Организации и индивидуальные предприниматели, применяющие систему налогообложения в виде единого налога на вмененный доход, не являются плательщиками НДС (п. 4 ст. 346.26 Налогового кодекса РФ)
В соответствии с пп. 1 п. 5 ст. 173 НК РФ лица, не являющиеся плательщиками НДС и выставившие счета-фактуры с выделенной суммой НДС, обязаны исчислить и уплатить в бюджет указанные в соответствующих счетах-фактурах суммы налога. То есть если “вмененщик” выставит покупателю товаров (работ, услуг) счет-фактуру с НДС, налог ему нужно уплатить.
Однако, согласно ст. 171 Налогового кодекса РФ правом на налоговые вычеты и на возмещение из бюджета налога на добавленную стоимость могут пользоваться только плательщики этого налога, а “вмененщики” не являются таковыми. Следовательно, плательщик ЕНВД не может предъявить НДС к вычету.
Кроме того у такого налогоплательщика возникает обязанность по представлению налоговой декларации по НДС в соответствии с п. 5 ст. 174 Налогового кодекса РФ
У покупателей с зачетом “входного” НДС по счетам-фактурам, выставленным плательщиками ЕНВД, также могут возникнуть проблемы. По мнению финансового и налогового ведомств, “вмененщики” оформляют счета-фактуры необоснованно. Поэтому права на вычет суммы НДС у налогоплательщиков, купивших у них товары (работы, услуги), не возникает.