Статья 264 главы 25 НК РФ к прочим расходам, связанным с производством и реализацией, относит суммы налогов и сборов, начисленные в установленном законодательством порядке, за исключением тех которые перечислены в статье 270 НК РФ.
Статьей 270 НК РФ предусматривает, что при определении налоговой базы не учитываются суммы налогов, предъявленных налогоплательщиком покупателю (приобретателю) товаров (работ, услуг, имущественных прав).
Поэтому уплаченный в бюджет НДС не уменьшает налогооблагаемую базу индивидуального предпринимателя.