Согласно п.1 ст.236 НК РФ, выплаты физическим лицам по гражданско-правовым договорам, предметом которых является выполнение работ, облагаются ЕСН. А страховые взносы в Пенсионный фонд РФ начисляются с той же базы, что и ЕСН.
Следовательно, Вам необходимо начислять страховые взносы в ПФ РФ с выплат лицам по гражданско-правовым договорам.