В соответствии со статьей 346.16 Налогового кодекса РФ о порядке признания расходов при упрощенной системе налогообложения при определении объекта налогообложения налогоплательщик уменьшает полученные доходы расходы, в том числе на расходы по оплате стоимости товаров, приобретенных для дальнейшей реализации (уменьшенные на величину налога на добавленную стоимость). Согласно Письма МНС РФ от 11.06.2003 г. №СА-6-22/657 расходами налогоплательщиков признаются затраты после их фактической оплаты.
При применении кассового метода определения доходов и расходов следует иметь в виду, что:
1) понесенные налогоплательщиками материальные затраты включаются в состав расходов, учитываемых при исчислении налоговой базы применительно к порядку, предусмотренному подпунктом 1 пункта 3 статьи 273 Кодекса;
2) стоимость приобретенных товаров включается в расходы того отчетного (налогового) периода, в котором фактически были получены доходы от реализации таких товаров;
3) расходы по товарам, приобретенным впрок и не реализованным в отчетном (налоговом) периоде, учитываются при получении доходов от реализации таких товаров в последующих отчетных (налоговых) периодах.
Следовательно, расходы по покупным товарам, предназначенным для дальнейшей реализации, признаются расходом только по мере реализации этих товаров. В Вашем случае, расходы по упрощенной системе налогообложения учтены неверно. Вам следует сделать уточненные декларации по упрощенной системе налогообложения и доплатить недоимку в бюджет.